Το Ινστιτούτο έχει τη δυνατότητα να συμμετέχει και σε Έργα του ΕΣΠΑ που, ιδίως, αποσκοπούν στην κοινωνική ευαισθητοποίηση και την προστασία ευάλωτων κοινωνικών ομάδων. Ταυτόχρονα, η δικτύωση του ΙΝΕΜΥ μέσω της επίτευξης συνεργασιών με άλλα Ερευνητικά Ινστιτούτα και Φορείς του Δημοσίου, δίνει τη δυνατότητα σε αρκετά Μέλη και Οργανώσεις που ανήκουν στην ΕΣΕΕ, να ενταχθούν σε κάποια από τα υλοποιούμενα προγράμματα. Σήμερα, το ΙΝΕΜΥ συμετέχχει στα εξής Έργα: